Bộ Tài chính hướng dẫn ba vướng mắc phổ biến trong quyết toán thuế thu nhập cá nhân (TNCN) tại doanh nghiệp: (1) khi người lao động đã ủy quyền nhưng sau quyết toán phát hiện thuộc đối tượng phải tự quyết toán (có số thuế phải nộp thêm); (2) cách ghi chứng từ khấu trừ thuế trong trường hợp này; (3) người lao động phải tự quyết toán lại và eTax Mobile chưa hỗ trợ chức năng này. Theo hướng dẫn từ Bộ Tài chính (dựa trên Thông tư 80/2021/TT-BTC và Nghị định 126/2020/NĐ-CP), doanh nghiệp phải điều chỉnh tờ khai quyết toán thuế TNCN khi phát hiện cá nhân không thuộc đối tượng ủy quyền. Chứng từ khấu trừ ghi số thuế đã khấu trừ/tạm nộp trong năm. Cá nhân phải tự đến cơ quan thuế để thực hiện quyết toán lại nếu ứng dụng chưa hỗ trợ. Doanh nghiệp không bị phạt nộp chậm nếu thực hiện đúng nghĩa vụ khấu trừ và kê khai dựa trên thu nhập thực tế trong kỳ tại doanh nghiệp.
Doanh nghiệp tạm ứng và nộp thuế TNCN thay cho người lao động. Vướng mắc gồm 3 tình huống:
Về điều chỉnh tờ khai quyết toán: Theo Thông tư 80/2021/TT-BTC ngày 29/9/2021 về quyết toán thuế TNCN: Khi phát hiện cá nhân không thuộc đối tượng ủy quyền, tổ chức chi trả phải thực hiện điều chỉnh tờ khai quyết toán thuế TNCN theo quy định tại Điều 47 Luật Quản lý thuế và Điều 47 Nghị định 126/2020/NĐ-CP. Đồng thời cấp chứng từ khấu trừ thuế TNCN để cá nhân tự quyết toán.
Về nội dung chứng từ khấu trừ: Chứng từ khấu trừ thuế TNCN ghi số thuế TNCN đã khấu trừ, tạm nộp trong năm (không phải số thuế sau quyết toán). Cá nhân căn cứ vào chứng từ này để kê khai quyết toán tổng thu nhập từ tất cả nguồn.
Về trách nhiệm của doanh nghiệp: Doanh nghiệp thực hiện đúng nghĩa vụ khấu trừ tại nguồn đối với thu nhập phát sinh tại doanh nghiệp; trách nhiệm của doanh nghiệp giới hạn ở phần thu nhập trả qua doanh nghiệp. Không có cơ sở xác định chậm nộp nếu doanh nghiệp đã nộp đúng, đủ số thuế khấu trừ.
Về cách thức tự quyết toán: Nếu eTax Mobile chưa hỗ trợ chức năng quyết toán lại, cá nhân có thể trực tiếp đến cơ quan thuế hoặc nộp hồ sơ qua Cổng Dịch vụ công quốc gia/cổng thuế điện tử theo quy định hiện hành.
Căn cứ pháp lý: Điều 17 Luật Thuế TNCN; Thông tư 80/2021/TT-BTC; Nghị định 126/2020/NĐ-CP; Thông tư 111/2013/TT-BTC (về ủy quyền quyết toán); Thông tư 92/2015/TT-BTC.
