Một người lao động phát hiện mình vô tình được cấp hai mã số thuế thu nhập cá nhân (MST) mà không rõ lý do. Khi công ty quyết toán thuế thu nhập cá nhân (TNCN) cho người này, hai người phụ thuộc (NPT) của người lao động lại được đăng ký theo mã số thuế thứ hai, trong khi việc quyết toán thực hiện qua mã số thuế thứ nhất. Người lao động lo ngại có thể không được tính giảm trừ gia cảnh cho hai người phụ thuộc này. Trả lời câu hỏi, Thuế tỉnh Thái Nguyên dẫn khoản 4 Điều 37 Thông tư số 90/2026/TT-BTC ngày 30/6/2026 của Bộ Tài chính quy định về đăng ký thuế: cá nhân đã được cấp nhiều hơn một mã số thuế phải cập nhật số định danh cá nhân cho tất cả các mã số thuế đã cấp, để cơ quan thuế tích hợp các mã số vào số định danh cá nhân và hợp nhất dữ liệu thuế theo số định danh này. Sau khi tích hợp, các hóa đơn, chứng từ, hồ sơ thuế đã lập trước đó bằng bất kỳ mã số thuế nào trong số đó vẫn tiếp tục có giá trị sử dụng cho các thủ tục hành chính thuế và chứng minh việc thực hiện nghĩa vụ thuế, mà không cần điều chỉnh sang số định danh cá nhân. Nói cách khác, một khi hai mã số thuế được hợp nhất vào cùng một số định danh cá nhân, thông tin người phụ thuộc đã khai theo mã số thứ hai vẫn được công nhận là của cùng người lao động đó. Cơ quan thuế cũng dẫn Công văn số 3422/CT-NVT ngày 27/5/2026 của Cục Thuế (kèm Phụ lục 01) hướng dẫn cách tra cứu trạng thái mã số thuế và thực hiện cập nhật số định danh cá nhân, đề nghị người nộp thuế thực hiện theo đúng hướng dẫn này để đảm bảo quyền lợi giảm trừ gia cảnh không bị ảnh hưởng.
Bà Đào Thị Mai phản ánh: công ty của bà có một người lao động (NLĐ) được cấp hai mã số thuế (MST) cá nhân mà bản thân người lao động cũng không rõ lý do. Khi công ty thực hiện quyết toán thuế thu nhập cá nhân (TNCN) qua cơ quan chi trả thu nhập, hồ sơ quyết toán theo mã số thuế thứ nhất kê khai 2 người phụ thuộc (NPT), nhưng trên hệ thống, 2 người phụ thuộc đó lại đang gắn với mã số thuế thứ hai. Về bản chất đây vẫn là một người lao động duy nhất, chỉ khác là thông tin người phụ thuộc bị lưu dưới mã số thuế khác. Bà Mai hỏi: người phụ thuộc khai khi quyết toán thuế theo mã số thuế thứ nhất (không phải mã số thuế thứ hai) có được tính giảm trừ gia cảnh hay không?
Thuế tỉnh Thái Nguyên trả lời dựa trên khoản 4 Điều 37 Thông tư số 90/2026/TT-BTC ngày 30/6/2026 của Bộ Tài chính quy định về đăng ký thuế, quy định chuyển tiếp như sau:
«4. Trường hợp cá nhân đã được cấp nhiều hơn 01 (một) mã số thuế, người nộp thuế phải cập nhật thông tin số định danh cá nhân cho các mã số thuế đã được cấp để cơ quan thuế tích hợp các mã số thuế vào số định danh cá nhân, hợp nhất dữ liệu thuế của người nộp thuế theo số định danh cá nhân.
Khi mã số thuế đã được tích hợp vào số định danh cá nhân thì các hóa đơn, chứng từ, hồ sơ thuế, giấy tờ có giá trị pháp lý khác đã lập có sử dụng thông tin mã số thuế của cá nhân tiếp tục được sử dụng để thực hiện các thủ tục hành chính về thuế, chứng minh việc thực hiện nghĩa vụ thuế mà không phải điều chỉnh thông tin mã số thuế trên hóa đơn, chứng từ, hồ sơ thuế sang số định danh cá nhân.»
Cơ quan thuế cũng dẫn Công văn số 3422/CT-NVT ngày 27/5/2026 của Cục Thuế (tại Phụ lục 01) về việc cá nhân đã được cấp nhiều mã số thuế và cập nhật số định danh cá nhân. Công văn này đã hướng dẫn cụ thể cách tra cứu trạng thái mã số thuế và cập nhật số định danh cá nhân.
Thuế tỉnh Thái Nguyên đề nghị người nộp thuế nghiên cứu Công văn số 3422/CT-NVT và thực hiện đúng theo hướng dẫn, cụ thể là:
Lưu ý: Câu trả lời gốc không nêu trực tiếp bằng một câu 'có' hoặc 'không' cho câu hỏi giảm trừ gia cảnh, mà hướng dẫn người nộp thuế thực hiện hợp nhất mã số thuế theo số định danh cá nhân - sau khi hợp nhất, dữ liệu người phụ thuộc sẽ được công nhận chung, không phân biệt mã số thuế cũ nào đã được dùng để khai.