Bộ Tài chính hướng dẫn về ưu đãi thuế TNDN cho doanh nghiệp khoa học và công nghệ (KHCN) đã được cấp giấy chứng nhận từ 2017 nhưng chưa áp dụng ưu đãi, nay muốn hưởng phần còn lại từ năm 2025. Theo Luật Thuế TNDN số 67/2025/QH15, doanh nghiệp KHCN được áp dụng thuế suất 10% trong 15 năm, miễn thuế 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo. Điều 68 Nghị định 268/2025/NĐ-CP xác nhận: doanh nghiệp đã được cấp Giấy chứng nhận doanh nghiệp KHCN nhưng chưa hưởng ưu đãi thì tiếp tục được hưởng cho thời gian còn lại. Cần lưu ý điều kiện cấp Giấy đã thay đổi theo Nghị định 268/2025/NĐ-CP (thẩm quyền cấp chuyển về UBND tỉnh; thêm điều kiện về chi cho R&D và nhân lực KHCN). Doanh nghiệp cần căn cứ vào hồ sơ thực tế và liên hệ cơ quan thuế trực tiếp để xác định thời gian ưu đãi còn lại và điều kiện áp dụng.
Doanh nghiệp KHCN được cấp Giấy chứng nhận từ năm 2017 nhưng chưa áp dụng chính sách ưu đãi giảm thuế. Năm 2025 muốn hưởng ưu đãi thuế TNDN cho thời gian còn lại: thuế suất 10%, miễn 4 năm, giảm 50% trong 9 năm tiếp theo. Liệu năm 2025 có đủ điều kiện áp dụng không?
Khoản 1 Điều 12 Nghị định 13/2019/NĐ-CP: Thu nhập của doanh nghiệp KHCN từ hoạt động sản xuất, kinh doanh sản phẩm từ kết quả KHCN được hưởng ưu đãi: miễn thuế 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo.
Luật Thuế TNDN số 67/2025/QH15 (Điều 12 khoản 2e; Điều 13 khoản 1; Điều 14 khoản 1): Doanh nghiệp KHCN thuộc ngành nghề ưu đãi, được áp dụng thuế suất 10% trong 15 năm, miễn thuế 4 năm và giảm 50% trong 9 năm tiếp theo. Thời gian áp dụng và thời điểm bắt đầu miễn/giảm thuế theo khoản 7 Điều 13 và khoản 4 Điều 14 Luật Thuế TNDN số 67/2025/QH15.
Điều 53 Nghị định 268/2025/NĐ-CP: Giấy chứng nhận doanh nghiệp KHCN được kiểm tra định kỳ 3 năm. Thu hồi khi: doanh nghiệp giải thể/phá sản, không báo cáo 3 năm liên tiếp, mất quyền sở hữu/sử dụng công nghệ, không đảm bảo điều kiện 3 năm liên tiếp.
Điều 68 Nghị định 268/2025/NĐ-CP: Doanh nghiệp đã được cấp Giấy chứng nhận doanh nghiệp KHCN nhưng chưa hưởng ưu đãi thì tiếp tục được hưởng cho thời gian còn lại theo văn bản pháp luật trước đây. Nếu đáp ứng điều kiện mới tại Nghị định 268/2025/NĐ-CP, có thể đề nghị cấp đổi Giấy chứng nhận và hưởng ưu đãi theo quy định mới.
Doanh nghiệp KHCN được cấp Giấy chứng nhận từ 2017 nhưng chưa hưởng ưu đãi: được phép hưởng ưu đãi cho thời gian còn lại theo quy định. Cần xác định năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế để tính thời hạn miễn/giảm thuế còn lại, và liên hệ cơ quan thuế trực tiếp để xác nhận.
