Hướng dẫn thuế GTGT đối với doanh nghiệp mua bán sản phẩm nông lâm nghiệp sơ chế - khấu trừ, hoàn thuế và hạch toán chi phí

Hướng dẫn thuế GTGT - Sản phẩm nông lâm nghiệp sơ chế

Nguồn: Cục Thuế, hỏi đáp ngày 18/05/2026

1. Chính sách thuế GTGT đối với sản phẩm nông lâm nghiệp sơ chế

Theo Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 (sửa đổi bởi Luật số 149/2025/QH15) và Nghị định 181/2025/NĐ-CP (sửa đổi bởi Nghị định 359/2025/NĐ-CP, hiệu lực 01/01/2026):

Khoản 1b Điều 4 Nghị định 181/2025 (mới bổ sung):

• Doanh nghiệp, HTX mua sản phẩm cây trồng, rừng trồng, chăn nuôi, thủy sản nuôi trồng, đánh bắt chưa chế biến hoặc chỉ qua sơ chế thông thường bán cho doanh nghiệp/HTX khác: không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT, nhưng được khấu trừ thuế GTGT đầu vào.
• Nếu bán cho hộ/cá nhân, tổ chức kinh tế khác: phải tính thuế GTGT 5%.
• Hộ, cá nhân kinh doanh nộp thuế theo phương pháp trực tiếp: tính thuế theo tỷ lệ 1% trên doanh thu.

Sản phẩm sơ chế thông thường bao gồm: làm sạch, phơi, sấy, băm, nghiền, cắt, bảo quản lạnh, v.v.

2. Điều kiện hoàn thuế GTGT

Theo Điều 15 Luật Thuế GTGT, được hoàn thuế trong các trường hợp:

• Có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu với thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên.
• Có dự án đầu tư mới đang trong giai đoạn đầu tư.
• Chỉ sản xuất hàng hóa, dịch vụ chịu thuế suất 5% với thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết từ 300 triệu đồng sau 12 tháng hoặc 4 quý liên tục.
• Giải thể/phá sản có thuế GTGT nộp thừa.

3. Xử lý thuế GTGT đầu vào không được hoàn, không được khấu trừ

Theo khoản 2l Điều 9 Luật Thuế TNDN số 67/2025/QH15: thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết nhưng không thuộc trường hợp hoàn thuế và có liên quan trực tiếp đến sản xuất kinh doanh được tính vào chi phí được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN. Lưu ý: khi đã tính vào chi phí thì không được khấu trừ với thuế GTGT đầu ra.

4. Phương pháp hạch toán

• Cách 1: Hạch toán thẳng giá bao gồm thuế vào chi phí từng nghiệp vụ.
• Cách 2: Hạch toán vào tài khoản 1331, sau đó cuối kỳ kết chuyển vào chi phí tương ứng. Cả hai cách đều được chấp nhận nhưng cần tuân thủ quy định kế toán hiện hành.